Główne wskazania do wykonania zabiegu falloplastyki to:
- Dysforia płciowa, czyli potrzeba chirurgicznej korekty narządów płciowych u osób transpłciowych.
- Wady wrodzone, takie jak agenezja penisa (brak narządu od urodzenia).
- Urazy i związane z nimi amputacje.
- Leczenie nowotworów (amputacja prącia będąca wynikiem leczenia).